在温病治疗上，赵绍琴善于运用叶天士"透热转气"法救治高热不退、昏迷等危重病证。他把透热转气法广泛地应用于温病卫、气、营、血各个阶段的治疗，以透邪外出为指导原则，取得了很好的治疗效果，大大地发展了叶天士的温病辨治理论。如温病气分证，使用辛寒清气的治法达热外出。营分证的治疗在清营养阴中，适当加入具有开达、宣透作用的药物，以去其壅塞、排除障碍、宣畅气机，使邪有出路，则入营之邪即可外透，转出气分而解。如湿热入营，可用芳香化湿清热以开郁，疏通气机，使营热外达。如邪入心包，轻者用菖蒲、郁金清心豁痰、开窍通闭，连翘轻清透泄、宣畅气机，重者必用牛黄、至宝丹之类以开其闭，使营热外透。对于瘀血阻滞气机而热邪入营者，则应于散血之品加入琥珀、桃仁、丹皮等，活血散瘀通络，排除障碍，宣通气机，导热达外。他认为，以上宣畅气机的治法皆属透热转气范畴。即使温邪入了血分，仍应考虑透热转气之理。

在内科临床方面，赵绍琴以善治疑难重证而著称。他创造性地把温病卫气营血的理论应用到内科杂病治疗中，对一些疑难病证主张从营血分进行辨证，如白血病、再生障碍性贫血、血小板减少性紫癜、病毒性心肌炎、系统性红斑狼疮、慢性肾小球肾炎、肾病综合征、慢性肾功能衰竭、尿毒症等，均取得了满意疗效。他认为，内科病症多由邪气阻闭气机，人体气血循行障碍，内郁不宣，邪气不得泄越，蕴蓄于内引起。所以内科杂病的治疗，可用解郁、疏利、宣泄等法，开散郁结，宣通其滞，调畅气血，通达营卫。治疗时，他喜用升降散(白僵蚕、蝉蜕、广姜黄、生大黄)，寒温并用，升降相因，宣畅三焦，条达气血，使周身气血流畅，火郁之邪可得宣泄疏发。根据他的经验，治火郁证需酌加风药，如防风、荆芥穗、苏叶等，以风药行气开郁，调畅气机，通达腠理而发其郁火。

赵绍琴一生致力于中医教学及临床工作，先后培养中医温病专业硕士研究生20余名，其弟子辛松峰、董宜华、彭建中、赵崇学、王洪图、杨连柱等已成为中医界的后起之秀。

弟子辛松峰，参与《中医养生学》第一版的编写，1992年在日本成立国际中医综合研究所，成为日本中部地区的名医，将赵绍琴先生的医术发扬光大。

弟子董宜华，著有《四库全书一家类消渴症治全录注疏》二百余万字，《名医经方验案》等八部专著，论文数十篇，参加美国九五化学年会获卫生部科技三等奖，2009年度和谐中国十大领军人物。

著有《四库全书一家类消渴症治全录注疏》二百余万字，《名医经方验案》等八部专著，论文数十篇，参加美国九五化学年会获卫生部科技三等奖，2009年度和谐中国十大领军人物。

专业特长:集众家之所长，医术精湛。擅治急慢性肾小球肾炎，肾病综合症、糖尿病肾病、肾盂肾炎、多囊肾、肾囊肿、肾积水、急性肾功能衰竭、肾功能不全、尿毒症及心、肝、脾、肺、肾、糖尿病、高血压、脑病综合症、精神抑郁、疼痛、失眠、癫痫、肿瘤、癌症等各种疑难杂症。